Osmanlı imparatorluğu zamanında varlığını "yeronda - yoran" ismi ile sürdürmüstür. 1955 depreminden sonra önceleri halk arasinda "HiSAR" olarak da adlandırılan YORAN devlet tarafından yaptırılan afet evlerine taşındıktan sonra "YENiHiSAR" adını almıştır. Sonrasında isim benzerliğine meyil vermemek için dünya üzerinde sadece bir yerde blunan ve kök olarak "DIDYMAION"'dan gelen  "DIDIM" olarak yenilemiştir.

Apollon kültünün merkezlerinden biri ve kehanet ocağı idi. Miletos şehriyle arasındaki bağlantı deniz yoluyla sağlanmıştı. Didimi ziyaret etmek isteyen ziyaretçiler zamanın deniz vasıtalarıyla Panormos limanına gelmekte ve burada karaya çıkarak, taş döşeli kutsal yoldan Didime ulaşıyorlar idi. Bayram alaylarıda bu kutsal yoldan harekete geçer, tapınağın çevresine gelinir ve burada meşale koşuları, yarışlar .. şenlikler düzenlenirdi. Kutsal yolun son iki kilometresinde geniş koltuklara oturan kadın ve erkek heykelleri ( Brankhidai ) vardı.

M.Ö. 499'da Perslere karşı Miletos şehrinin başkanlığında ayaklanan İonia şehirleri M.Ö 494 yılına doğru Persler tekrar boyun eğdi. Miletos şehrinin yakınlarındaki Lade adası yakınlarında yapılan deniz savaşından sonrada Miletos ele geçirildi. Didimde birikmiş olan yunan hazineleri yağma edildi, şehir yakılıp yıkıldı. Persler Hititlerden ve Asurlar dan kalma bir usule uyarak buraların halkını Ön Asyaya sürüp Dicle boylarına yerleştirdiler. 331 Yılında Didim kahini, Büyük İskender'i burada Zeus'un Oğlu ilan etti. M.Ö II yy.dan sonra burada yapılan ve Didymeia adı verilen şenlikler Yunanlıların Didima'da bir araya gelmelerini sağladı. Kolonizasyon hareketlerinde burası haber alma merkezi olarak kullanıldı ( koloniler kehanet merkezince belirtilen kıyılarda kurulur idi )